Las áreas Silvestres Protegidas por el Estado en la región de Los Lagos constituyen una muestra representativa de la variada gama de comunidades que conforman los ecosistemas templados-Lluvioso del sur de Chile. Están presentes bosques Alerzales, Cipresales y Tepuales, bosques Nordpatagónicos dominados por mirtáceas, bosques Caducifolios, bosques Laurifolios, bosques Andino-patagónicos, bosques Siempreverdes y Turberas, con especies únicas que sólo se encuentran en esta región del país.
En el caso de los mamíferos, existe una gran variedad de especies de gran interés científico como el Zorro de Darwin, el que se distribuye en la isla Grande de Chiloé y en forma insólita en la cordillera de Nahuelbuta en la Región de La Araucanía. Otros zorros que se encuentran en la región son el Zorro Chilla y el Zorro Culpeo. En el caso de los felinos se encuentra el gato Guiña, el felino más pequeño de Chile y el puma como el depredador de mayor tamaño.
Importante es destacar que la presencia del Huemul, animal heráldico de Chile y el Pudú, pequeño cervatillo que habita los bosques nativos del centro y sur de Chile y Argentina.
Areas Protegidas Región de Los Lagos
- Parque Nacional Puyehue
- Parque Nacional Vicente Pérez Rosales
- Reserva Nacional Llanquihue
- Parque Nacional Alerce Andino
- Monumento Natural Lahuen Ñadi
- Monumento Natural Islotes Puñihuil
- Parque Nacional Chiloé
- Parque Pumalín
- Parque Nacional Hornopirén
- Reserva Nacional Futaleufú
- Reserva Nacional Lago Palena